거북선은 기능에 따라 공격형과 방어형 두 가지 형태로 운용되었다는 연구 결과가 나왔다. 국립해양유산연구소는 '거북선 학술 복원 보고서'를 통해 1795년 기록의 통제영 거북선과 전라좌수영 거북선 두 척을 독립적으로 연구했다. 이는 두 선박에 대한 공학적 검증이 처음으로 이루어진 사례이다.