정부는 영남·호남·강원권의 지역 국립과학관을 통합하여 효율성을 높이려 한다. 그러나 과학관 노동조합은 구성원 간 소통 부족과 지역 과학문화 격차 해소라는 역할을 무시한 채 통폐합을 추진하는 것에 반대하고 있다. 이는 정부의 유사·중복 기능 공공기관 통폐합 기조에 따른 것이다.