2차 종합특검팀은 김명수 전 합동참모본부 의장 등 합참 관계자들을 12·3 비상계엄 가담 혐의로 재판에 넘겼다. 특검팀은 김 전 의장이 불법적인 계엄 선포를 지원하고 참모들의 국회 병력 철수 건의를 묵살했다고 판단했다.이 과정에서 2차 종합특검팀이 수사를 담당했다.