하야부사2는 소행성을 지나가며 일본의 행성 방어 데이터를 확보하는 것을 목표로 한다. 이는 2020년에 소행성 류구에서 샘플을 지구로 가져온 후의 새로운 단계이다. 이 임무는 행성 방어 관련 데이터 확보에 중점을 둔다.