부산상의와 상사중재원은 업무협약을 맺고 법적 분쟁 지원, 중재·조정, 분쟁예방 교육 등 지역 기업 맞춤형 협력사업을 추진한다. 이는 두 기관이 공동으로 기업 분쟁 해결을 지원하기 위함이다. 부산상공회의소와 상사중재원이 협력하고 있다.