제주 해양보호구역에서 폐어구로 인한 생태계 훼손이 확인되었다. 시민과학 프로젝트 '폐어구 탐사대'가 제주도 해양보호구역을 대상으로 조사를 실시했다. 이 조사를 통해 보호구역별 폐어구 유형과 분포, 생태계에 대한 정보가 수집되었다.