교육부는 배재고 야구부 사태를 계기로 학교 현장의 혐오와 차별에 대한 예방 및 대응 자료를 만들었다. 이 자료에서 일부 학부모의 민원이 우려된다는 이유로 성적 지향과 성별 정체성 항목이 삭제되었다. 이는 학교에서 발생하는 차별로부터 보호해야 할 성소수자에 대한 내용이 일부 학부모의 민원 때문에 제외된 것이다.