제주특별자치도는 최근 5년간 농가에 집행하지 않은 FTA 기금을 반납하지 않아 페널티를 받을 상황이다. 해당 미반납 금액은 2020년부터 2024년까지 총 89억 원에 달한다.이는 고품질 감귤 생산을 위한 FTA 기금과 관련되어 있다.