2024년 12월 3일 내란 당시 수도방위사령부 제1경비단장이었던 조성현 대령이 입건된 것에 대해 논란이 발생하고 있다. 내란특검과 종합특검 간에 조성현 대령의 역할 및 입건 여부에 대한 이견으로 갈등이 심화되었다. 현재 관련 수사가 진행 중이다.